Date of Publication

3-2026

Document Type

Bachelor's Thesis

Degree Name

Bachelor of Science in Biology major in Medical Biology

College

College of Science

Department/Unit

Biology

Thesis Advisor

Chona Camille V. Abeledo

Defense Panel Chair

Yokimiko D. Torrejos

Defense Panel Member

Hilarie P. Orario
Laurence E. Robles

Abstract (English)

Mollusks are economically significant, with vast applications in medicine, food, and craft, among others. In the Verde Island Passage (VIP), a biodiversity-rich strait, mollusk studies have mostly focused on specific group/s (e.g., octopus, gastropods) and/or does not integrate both morphological and molecular methods for species identification. Through integrated morphological and molecular identification, this study aims to identify the economically important mollusks within the Western Batangas Region of the VIP. Samples were collected from the public markets in the municipalities of Nasugbu, Calatagan, and Lian, Batangas. Species identification was carried out using morphological characters and COI gene barcoding. Phylogenetic relationships and genetic distances across taxonomic  groups were also analyzed. Morphological identification determined eight species (Uroteuthis duvaucelii, Octopus cyanea, Telescopium telescopium, Crassostrea iredalei, Isognomon ephippium, Geloina expansa, Sepioteuthis lessoniana, Sthenoteuthis oualaniensis). Except for one (Isognomon ephippium, which was molecularly identified to be Pinctada maxima), the molecular identification of all samples matched the morphological identification. Two samples did not meet one of the thresholds set for molecular identification. All species retained after removal of poor quality samples formed distinct species clades. Members of the same family, order, and class also formed distinct monophyletic groups among themselves. The generated NJ tree suggests that class Cephalopoda is more closely related to class Gastropoda. Adopting the commonly used threshold < 3%, the computed mean intraspecific genetic distance showed conspecificity for Octopus cyanea, Crassostrea iredalei, Sthenoteuthis oualaniensis, and Uroteuthis duvaucelii while Telescopium telescopium and Sepioteuthis lessoniana appeared to be more genetically divergent in contrast to others. Compared to previous studies, the genetic distance in the phylum-level was relatively similar, but lower intrafamilial and higher intraclass were computed. Results indicate ambiguous identifications for one and two samples from both morphological and molecular methods, respectively. With this, it is recommended that an integrated approach of both methods is used for species identification. Further research is needed to determine other economically important mollusks in the VIP using other methods for morphological identification or employing an alternative sampling design such as different provinces, seasons, or across multiple dates.

Abstract Format

html

Abstract (Filipino)

Ang mollusks ay mahalaga sa ekonomiya at may malawak na saklaw ng gamit, gaya ng sa medisina, pagkain, sining, at iba pa. Ang mga pananaliksik tungkol sa mollusks na matatagpuan sa Verde Island Passage (VIP), isang kipot na mayaman sa saribuhay, ay kadalasang nakatuon lamang sa isang partikular na grupo (hal., mga pugita,  gastropods) at/o hindi sinamahan ng parehong morpolohikal at molekular na mga pamamaraan ng pagkilala sa mga uri. Gamit ang pinagsamang morpolohikal at molekular na pagkilala, layunin ng pag-aaral na ito na tukuyin ang mollusks na may ekonomikong kahalagahan sa saklaw ng Western Batangas Region ng VIP. Ang mga sample ay kinolekta sa pampublikong pamilihan sa mga bayan ng Nasugbu, Calatagan, at Lian, Batangas. Ang pagkilala sa mga uri ay ginamitan ng mga morpolohikal na katangian at ng COI gene barcoding. Sinuri rin ang mga ebolusyonaryong ugnayan at mga henetikong distansya sa iba’t ibang taksonomikong pangkat. Walong uri ang natukoy gamit ang morpolohikal na pagkilala (Uroteuthis duvaucelii, Octopus cyanea, Telescopium telescopium, Crassostrea iredalei, Isognomon ephippium, Geloina expansa, Sepioteuthis lessoniana, Sthenoteuthis oualaniensis). Maliban sa isa (Isognomon ephippium, na natukoy bilang Pinctada maxima gamit ang pamamaraang molekular), tumugma ang molekular at morpolohikal na pagkakakilanlan ng lahat ng mga sample. Dalawa sa mga ito ay hindi naabot ang isa sa mga pamantayan ng molekular na pagkilala. Ang mga sample na may mahusay na kalidad ay bumuo ng mga natatanging clade, pati na rin ang mga miyembrong nabibilang sa parehong pamilya, order, at klase. Ipinahiwatig ng nabuong NJ tree na ang klase ng Cephalopoda ay may mas malapit na ugnayan sa klase ng Gastropoda. Batay sa karaniwang pamantayan na Octopus cyanea, Crassostrea iredalei, Sthenoteuthis oualaniensis, at Uroteuthis duvaucelii habang ang Telescopium telescopium at Sepioteuthis lessoniana ay nagpakita ng pinakamalaking henetikong pagkakaiba. Kumpara sa mga nagdaang pag-aaral, ang henetikong distansya sa antas ng phylum ay naaalinsunod, bagaman natukoy na mas mababa ang intrafamilial at mas mataas naman ang intraclass. Ang mga resulta ay nagpakita ng isang hindi tiyak na pagkakakilanlan gamit ang morpolohikal na pamamaraan, at dalawa naman para sa molekular. Bunga nito, iminumungkahi ang pag-iisa ng parehong pamamaraan para sa identipikasyon ng mga uri. Inirerekomenda rin ang paggamit ng iba pang pamamaraang morpolohikal, o disenyo ng sampling, gaya ng ibang probinsya, kapanahunan, at iba’t ibang petsa para sa karagdagang pananaliksik.

Abstract Format

html

Language

English

Format

Electronic

Keywords

Mollusks--Philippines; Verde Island Passage

Upload Full Text

wf_yes

Embargo Period

4-13-2027

Available for download on Tuesday, April 13, 2027

Share

COinS