Date of Publication

4-2026

Document Type

Bachelor's Thesis

Degree Name

Bachelor of Science in Biology major in Medical Biology

Subject Categories

Biology | Botany

College

College of Science

Department/Unit

Biology

Thesis Advisor

Sarah Grace S. Zamudio

Defense Panel Chair

Joanna S. Sanchez

Defense Panel Member

Jody M. Benedicto
John Martin S. Mondragon

Abstract (English)

Species identification is essential for the assessment and conservation of biodiversity, especially for biologically rich yet understudied areas like Zamboanga Peninsula. This study aimed to identify 14 unknown, distinct floral species collected in Barangay Sandayong, Zamboanga Sibugay, by employing both molecular and morphological confirmation. DNA barcoding demonstrated that only the matK region of unknown Species #7 had a successful amplification usable for sequencing and analysis. Results from the nucleotide BLAST search narrowed the identity of the species to Tropidia angulosa (PV424134.1; 100% query cover, 100.00 percent identity), Elleanthus caricoides (EU490684.1; 99% query cover, 100.00 percent identity), and Elleanthus ampliflorus (HQ329016.1; 100% query cover, 99.72 percent identity). The morphological confirmation further established the identity of the species as T. angulosa, as it possessed characteristic features of the genus Tropidia rather than Elleanthus. However, there were some slight differences between published descriptions of T. angulosa and the species of this study; such discrepancies can be attributed to environmental and geographic factors. In previous records, the species was already recorded in Luzon, particularly in the provinces of Laguna, Rizal, and Nueva Vizcaya; therefore, this study, using the matK barcode, marks the first record of T. angulosa in Mindanao. To further establish this finding, more barcodes should be used in the molecular confirmation of this species; and to confirm the identity of the other species, more attempts of DNA barcoding should be conducted.

Abstract Format

html

Abstract (Filipino)

Ang pagkilala sa mga species ay mahalaga para sa pagsusuri at konserbasyon ng biodiversity, lalo na sa mga lugar na mayaman sa buhay ngunit kulang sa pag-aaral tulad ng Zamboanga Peninsula. Ang pag-aaral na ito ay naglalayong kilalanin ang 14 na magkakaibang hindi pa natutukoy na mga halamang may bulaklak na nakolekta sa Barangay Sandayong, Zamboanga Sibugay, sa pamamagitan ng parehong molekular at morpolohikal na pagpapatunay. Ipinakita ng DNA barcoding na ang matK na rehiyon lamang ng unknown Species #7 ang nagkaroon ng matagumpay na amplification na maaring gamitin para sa sequencing at karagdagang pagsusuri. Ayon sa resulta mula sa nucleotide BLAST search, ang mga maaaring pagkakakilanlan ng species ay Tropidia angulosa (PV424134.1; 100% query cover, 100.00% identity), Elleanthus caricoides (EU490684.1; 99% query cover, 100.00% identity), at Elleanthus ampliflorus (HQ329016.1; 100% query cover, 99.72% identity). Higit pa na itinatag ng morpolohikal na pagpapatunay ang pagkakakilanlan ng species bilang T. angulosa, sapagkat ito ay nagtataglay ng mga katangiang tipikal ng genus na Tropidia kaysa sa Elleanthus. Gayunpaman, may ilang bahagyang pagkakaiba sa pagitan ng mga nailathala na paglalarawan ng T. angulosa at ng species na sinuri sa pag-aaral na ito; ang mga pagkakaiba na ito ay iniuugnay sa mga pangkapaligiran at heograpikong mga salik. Sa mga naunang tala, ang species na ito ay naitala na sa Luzon, partikular sa lalawigan ng Laguna, Rizal, at Nueva Vizcaya; samakatuwid, ang pag-aaral na ito, gamit ang matK barcode, ay nagmamarka ng unang tala ng T. angulosa sa Mindanao. Upang lalo na mapagtibay ang natuklasang ito, inirerekomenda ang paggamit ng mas maraming barcode sa molekular na pagpapatunay ng species na ito; at upang makumpirma ang pagkakakilanlan ng iba pang mga species, dapat mas maraming subok pa ng DNA barcoding ang isagawa.

Abstract Format

html

Language

English

Format

Electronic

Keywords

Plants--Philippines; Plants—Identification

Upload Full Text

wf_yes

Embargo Period

4-14-2029

Download

Available for download on Saturday, April 14, 2029

Share

COinS